2001年10月，科技部正式批准学校建设“作物遗传与种质创新国家重点实验室”，该实验室以南京农业大学“作物遗传与特异种质创新教育部重点开放实验室”“国家大豆改良中心”以及作物遗传育种、蔬菜学和植物营养学三个国家重点学科为依托建立。
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